Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rrp36Q3UFY0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp36Q3UFY0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms