Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garem1Q3UFT3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms