Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Puf60Q3UEB3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms