Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pid1Q3UBG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms