Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brf2Q3UAW9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms