Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssbp4Q3U4B1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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