Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
InipQ3TXT3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms