Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf6Q3TWW8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srsf6Q3TWW8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms