Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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