Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdnep1Q3TP92 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms