Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms