Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpgp1Q3TLS3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpgp1Q3TLS3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms