Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afvQ3THW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afvQ3THW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms