Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXG2

Fpr-rs6, Formyl peptide receptor-related sequence 6, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-rs6Q3SXG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fpr-rs6Q3SXG2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-rs6Q3SXG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms