Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3KNL4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms