Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms