Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Rpusd3Q14AI6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Rpusd3Q14AI6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Rpusd3Q14AI6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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