Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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