Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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