Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VgfQ0VGU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms