Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2b3Q0VF55 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms