Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms