Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms