Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnnm1Q0GA42 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnnm1Q0GA42 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms