Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms