Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms