Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tff1Q08423 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tff1Q08423 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tff1Q08423 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff1Q08423 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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