Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms