Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms