Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms