Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms