Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms