Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
AmbpQ07456 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms