Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf9Q07105 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms