Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms