Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox4Q06831 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms