Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms