Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apoc2Q05020 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms