Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms