Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms