Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms