Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms