Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col6a2Q02788 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms