Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms