Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms