Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mc1rQ01727 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms