Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms