Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gja5Q01231 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms