Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms