Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VegfaQ00731 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms